Le funzioni direttive sono affidate a un gruppo collegiale di direzione composto da sette membri: Piergiorgio Reggio (presidente, rappresentanza istituzionale), Katia Marai (coordinatrice di direzione, rappresentanza dei servizi educativi e coordinamento pedagogico), Roberto Cacciatore (rappresentanza della parte di amministrazione), Michelangelo Marchesi (rappresentanza del settore di progettazione e comunicazione), Luciana Paganini (rappresentanza dei servizi educativi), Giulio Piffer (rappresentanza della gestione delle risorse umane), Pietro Scarpa (rappresentanza del settore integrazione socio-lavorativa). 
La Direzione gestisce Progetto 92 e presidia l’operatività delle controllate Tuttoverde srl e Tuttoverde impresa sociale.
All’interno del gruppo collegiale di Direzione è stato definito il ruolo di Coordinatore di Direzione. Chi ricopre questo ruolo viene individuato esclusivamente tra responsabili di servizi educativi, sottolineando così la centralità della dimensione socio-educativa. Il mandato, rinnovato ogni tre anni dal CdA, prevede funzioni chiave, tra cui la convocazione delle riunioni e la conduzione di lavori e sedute, la rappresentanza istituzionale della Cooperativa (dove non di competenza del presidente), l’attuazione degli orientamenti decisionali della Direzione, l’assunzione di decisioni operative dove non si pronunci la Direzione, il monitoraggio dell’andamento della Cooperativa, l’assunzione delle funzioni istituzionali e di coordinamento pedagogico.